46067

Ethidium bromide solution

suitable for fluorescence, ~1% in H₂O

• Synonim(y): 3,8-Diamino-5-ethyl-6-phenylphenanthridinium bromide, EtBr, Homidium bromide
• Wzór empiryczny (zapis Hilla): C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS Number: 1239-45-8
• Masa cząsteczkowa: 394.31
• Beilstein: 3642536
• Numer MDL: MFCD00011724
• Kod UNSPSC: 12161505
• Identyfikator substancji w PubChem: 57650684
• NACRES: NA.32

Właściwości

• Poziom jakości: 100
• stężenie: ~1% in H₂O
• fluorescencja: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O; λ_ex 518 nm; λ_em 605 nm (bound to DNA); λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• przydatność: suitable for fluorescence
• temp. przechowywania: 2-8°C
• ciąg SMILES: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• Klucz InChI: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

Opis

Zastosowanie

Bromek etydyny (EtBr) jest najczęściej stosowanym barwnikiem kwasów nukleinowych do elektroforezy PAGE lub żelu agarozowego. Fluorescencja EtBr wzrasta 21-krotnie po związaniu z dwuniciowym RNA i 25-krotnie po związaniu dwuniciowego DNA, dzięki czemu odbarwianie tła nie jest konieczne przy niskim stężeniu barwnika (10 μg/ml). Bromek etydyny był stosowany w wielu testach fluorymetrycznych dla kwasów nukleinowych. Wykazano, że wiąże się z jednoniciowym DNA (choć nie tak silnie) i trójniciowym DNA. Ze względu na zdolność wiązania się z DNA, EtBr jest inhibitorem polimerazy DNA.

Działania biochem./fizjol.

Bromek etydyny interkaluje dwuniciowe DNA i RNA i działa jako mutagen z przesunięciem ramki. Może być również stosowany w połączeniu z oranżem akrydyny w celu rozróżnienia między żywymi, apoptotycznymi i nekrotycznymi komórkami.

Rekonstytucja

W celu wybarwienia żelu po elektroforezie należy rozcieńczyć próbkę roztworu podstawowego do 0,5 μg/ml wodą i inkubować żel przez 15-30 minut. Odbarwianie zwykle nie jest konieczne, ale można je przeprowadzić w wodzie przez 15 minut, jeśli konieczne jest zmniejszenie tła. Prążki DNA można następnie wykryć w lampie UV (długość fali 254 nm). Bromek etydyny można również dodać do żelu i buforu roboczego w stężeniu 0,5 μg/ml i wizualizować natychmiast po elektroforezie.

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Piktogramy: GHS06,GHS08
• Hasło ostrzegawcze: Danger
• Zwroty wskazujące rodzaj zagrożenia: H331,H341
• Zwroty wskazujące środki ostrożności: P202 - P261 - P271 - P280 - P304 + P340 + P311 - P308 + P313
• Klasyfikacja zagrożeń: Acute Tox. 3 Inhalation - Muta. 2
• Kod klasy składowania: 6.1D - Non-combustible acute toxic Cat.3 / toxic hazardous materials or hazardous materials causing chronic effects
• Klasa zagrożenia wodnego (WGK): nwg
• Temperatura zapłonu (°F): Not applicable
• Temperatura zapłonu (°C): Not applicable
• Środki ochrony indywidualnej: Eyeshields, Faceshields, Gloves, type ABEK (EN14387) respirator filter